Die Gruppe lehnte den „Waffenstillstand“ der SPD mit der deutschen Regierung unter Wilhelm II. in der Frage der Unterstützung des Ersten Weltkriegs ab und kämpfte vehement dagegen, indem sie versuchte, zu einem Generalstreik zurückzukehren. So wurde Luxemburg bereits am 28. Juni 1916 zu zweieinhalb Jahren Haft verurteilt, fast zeitgleich mit Karl Liebknecht. Während ihres Aufenthalts im Gefängnis wurde sie zweimal umgesiedelt, zuerst nach Poznań (Posen) und dann nach Wrocław (Breslau). Während dieser Zeit schrieb sie mehrere Artikel unter dem Namen „Junius“, die ihre Freunde herausgeschmuggelt und illegal veröffentlicht haben.

Dazu gehörte die Russische Revolution, die die Bolschewiki in mehreren Punkten kritisierte und vor allem vor der Gefahr warnte, dass sich eine Diktatur unter bolschewistischer Herrschaft entwickeln würde (sie forderte dennoch weiterhin eine „Diktatur des Proletariats“ nach dem bolschewistischen Modell). In diesem Zusammenhang schrieb sie die berühmte Freiheit ist immer die Freiheit des Andersdenkenden („Freiheit ist immer und ausschließlich Freiheit für den, der anders denkt“). Eine weitere Veröffentlichung im Juni 1916 trug den Titel Die Krise der Sozialdemokratie“.

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